61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1415 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  100 
 
 		 97 aa  194  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  77.32 
 
 		 97 aa  154  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  51.11 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  45.56 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  47.25 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  47.83 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  46.74 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  38.89 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  44.19 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  40.62 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  40.66 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  42.39 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4142  YCII-related  40.66 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0565  YCII-related protein  36.05 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  33.68 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  33.73 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  33.72 
 
 		 102 aa  52  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  34.88 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  30.26 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0388  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  35.16 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4142  YciI-like protein  31.82 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  28.24 
 
 		 89 aa  47.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  24.71 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2000  YCII-related  34.41 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  30.14 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  31.03 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  28.74 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  33.71 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  35.94 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  27.59 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  32.43 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  28.74 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  27.59 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  29.89 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  30.23 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  29.76 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  32.58 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  23.91 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  28.74 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1054  YciI-like protein  31.87 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0987  hypothetical protein  28.95 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000944025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1952  YciI-like protein  30.68 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  0.569612 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2391  YCII domain-containing protein  29.89 
 
 		 94 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  30.23 
 
 		 103 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  29.76 
 
 		 96 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2489  YCII-related  29.89 
 
 		 94 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1676  YCII domain-containing protein  29.89 
 
 		 94 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000604695  normal  0.185637 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  27.55 
 
 		 101 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2015  hypothetical protein  35.29 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1100  YciI-like protein  32.18 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  31.76 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  29.76 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  26.14 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  30.68 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  28.71 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1210  GTP cyclohydrolase II  36 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732067  normal  0.254823 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2620  YCII-related  35.38 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  29.11 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06281  YciI-like protein  23.38 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>