56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20150 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  189  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  59.57 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  50.53 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  46.24 
 
 		 97 aa  84.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  45.26 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  46.74 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  47.96 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  41.94 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  44.09 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4142  YCII-related  47.83 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  46.74 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  41.76 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  38.95 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  33.7 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02200  hypothetical protein  46.15 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  38.96 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  41.1 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  35.16 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  38.75 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  30.68 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2620  YCII-related  37.5 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  33.7 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  36.14 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0565  YCII-related protein  38.16 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  38.1 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  34.94 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  35.71 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  28.41 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1641  YciI-like protein  32.61 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  32.14 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  33.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  37.18 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  32.5 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  32.5 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  33.71 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  33.71 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  33.71 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5012  YciI-like protein  35.96 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2510  YCII-related  31.18 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0139  YCII-like protein  45.31 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  35.71 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  35.71 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  35.71 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  35.96 
 
 		 92 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  31.08 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  28.74 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  31.76 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  31.08 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  34.83 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  24.18 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  38.36 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  31.08 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2000  YCII-related  36.62 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  43.86 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  35.38 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  30.12 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>