106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1540 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  100 
 
 		 97 aa  189  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  48.94 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  47.87 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  46.24 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  47.73 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  47.31 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  48.96 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4142  YCII-related  46.81 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  41.49 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  40.62 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  40.21 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  40.43 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  37.5 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02200  hypothetical protein  45.26 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  29.9 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  36.99 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  32.97 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  36.08 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  35.21 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  29.7 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  38.78 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  34.04 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  31.58 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  37.18 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  32.98 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  30 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  29.9 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  32.98 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  36 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  35.44 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  36.99 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  37.5 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1484  YCII-related  40.58 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  35.9 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  33.77 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  30.11 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  30.11 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  30.11 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  30.11 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  30.11 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  36.25 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22780  YciI-like protein  37.18 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.064842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0565  YCII-related protein  31.87 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  34.62 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1924  YciI-like protein  37.18 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914031  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  32.89 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  35.9 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  29.29 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  37.5 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  32.53 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  34.18 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1098  hypothetical protein  34.67 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  35.44 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  35.44 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  35.44 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  35.44 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  35.44 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  35.44 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  35.44 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  34.18 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  34.15 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  32.91 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  32.91 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1079  hypothetical protein  25 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  35.44 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  35.9 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  32.91 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  32.91 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  32.91 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  32.93 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  32.91 
 
 		 98 aa  42.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  32.91 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  32.91 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  34.18 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  31.25 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  32.93 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1459  YCII-related protein  31.87 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0718  YciI-like protein  31.25 
 
 		 99 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  33.73 
 
 		 99 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  29.9 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0345  hypothetical protein  28.12 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150147  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  31.71 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  31.71 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19541  hypothetical protein  24 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2261  YciI-like protein  32.43 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0972  YciI-like protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2688  YCII-related  30 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  34.62 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1994  YCII-related protein  29.9 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1890  YciI-like protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  32.93 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1818  YciI-like protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0636505  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  36.08 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4444  YCII-related  32.05 
 
 		 286 aa  40.8  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0302948  normal  0.210377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1716  YciI-like protein  29.9 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1975  YciI-like protein  25.26 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  30.43 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  32.94 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>