85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1434 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  100 
 
 
125 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  98.96 
 
 
124 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  79.17 
 
 
96 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  79.17 
 
 
96 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  79.17 
 
 
96 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  75 
 
 
96 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  77.08 
 
 
96 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  76.04 
 
 
96 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  76.04 
 
 
96 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  70.97 
 
 
96 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  70.97 
 
 
96 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  66.3 
 
 
96 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2620  YCII-related  50.56 
 
 
95 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0757  YCII-related protein  48.86 
 
 
100 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00179224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  44.83 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  43.18 
 
 
96 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  43.96 
 
 
97 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  43.96 
 
 
97 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  42.86 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1911  YCII-related  46.15 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  45.12 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0916  YCII-related  44.44 
 
 
95 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  39.13 
 
 
96 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3244  YCII-related  45.12 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  43.82 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  41.38 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  39.56 
 
 
94 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1883  YCII-related  40.43 
 
 
94 aa  77.8  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113856  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2391  YCII domain-containing protein  40.74 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1676  YCII domain-containing protein  40.74 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000604695  normal  0.185637 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2489  YCII-related  40.74 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  43.96 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1926  YCII-related  43.96 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  40.62 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  40.62 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  39.08 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2457  hypothetical protein  46.15 
 
 
97 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  43.53 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  43.18 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1804  YCII-related  35.56 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0682479  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2510  YCII-related  32.58 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0553875  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  36.96 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  39.77 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  35.05 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  34.38 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1762  YCII-related  35.37 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106659  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2107  YCII-related  43.96 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.951624 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  32.1 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  30.86 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31170  hypothetical protein  38.64 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.814554  normal  0.945113 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1871  YCII-related  42.86 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3299  YCII-related protein  32.61 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  29.76 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2373  YCII-related  29.89 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1210  GTP cyclohydrolase II  35.8 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732067  normal  0.254823 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0660  hypothetical protein  36.59 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  32.22 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1351  hypothetical protein  36.49 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  32.22 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4873  hypothetical protein  30.77 
 
 
102 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3292  hypothetical protein  30.77 
 
 
102 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0139  YCII-like protein  34.88 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6976  hypothetical protein  30.38 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1417  hypothetical protein  30.67 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000127733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1511  hypothetical protein  29.11 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6318  hypothetical protein  29.11 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1877  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2002  YCII-related  26.44 
 
 
98 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000615778  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0987  hypothetical protein  27.4 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000944025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0970  YCII-related protein  32.89 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0504  hypothetical protein  31.87 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2720  hypothetical protein  29.73 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  35.87 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  35.44 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  29.73 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5356  hypothetical protein  32.56 
 
 
352 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  41.82 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  30.43 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  32.91 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>