79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2992 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  100 
 
 		 102 aa  207  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  83.33 
 
 		 102 aa  177  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  68.63 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2720  hypothetical protein  60.78 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6976  hypothetical protein  43.14 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1511  hypothetical protein  43 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6318  hypothetical protein  43 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0388  hypothetical protein  39.22 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3292  hypothetical protein  41.18 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4873  hypothetical protein  41.18 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  43.37 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  35.56 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  35.9 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  35.56 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3244  YCII-related  31.11 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  31.03 
 
 		 96 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  36.47 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  31.68 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  31.68 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  32.22 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  31.11 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  31.11 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  35.9 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  36.99 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  32.22 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  32.22 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  32.22 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  32.22 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  32.22 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  32.22 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  31.11 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  30.77 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  30.43 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  31.11 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  30 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  32.35 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  26.74 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0660  hypothetical protein  32.14 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  30.88 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2620  YCII-related  28.57 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  30.77 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0757  YCII-related protein  32.05 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00179224  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1883  YCII-related  30.88 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113856  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  30.77 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1351  hypothetical protein  30 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0916  YCII-related  32.05 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1210  GTP cyclohydrolase II  31.46 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732067  normal  0.254823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  30.77 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  36.23 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2373  YCII-related  27.78 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  26.44 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  31.88 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1926  YCII-related  35.29 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  28.57 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  27.78 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  27.71 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1804  YCII-related  33.82 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0682479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  28.92 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1417  hypothetical protein  22.83 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2391  YCII domain-containing protein  33.82 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2489  YCII-related  33.82 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1676  YCII domain-containing protein  33.82 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000604695  normal  0.185637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31170  hypothetical protein  29.49 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.814554  normal  0.945113 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2107  YCII-related  35.29 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.951624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1911  YCII-related  33.82 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  24.05 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  28.57 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  28.57 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  26.76 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0139  YCII-like protein  27.66 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  32.35 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  33.82 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  32.35 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  30.86 
 
 		 94 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  25.29 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  26.92 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1871  YCII-related  33.82 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  25.81 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>