82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2335 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  100 
 
 		 97 aa  193  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  98.97 
 
 		 97 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  97.94 
 
 		 97 aa  190  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1911  YCII-related  89.69 
 
 		 97 aa  174  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2457  hypothetical protein  81.44 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1926  YCII-related  71.13 
 
 		 92 aa  137  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2107  YCII-related  77.32 
 
 		 97 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.951624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1871  YCII-related  76.29 
 
 		 97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1804  YCII-related  61.29 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0682479  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  56.84 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  54.74 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  51.61 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  56.47 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  53.41 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  50 
 
 		 96 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1883  YCII-related  52.69 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113856  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0916  YCII-related  53.76 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  50 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3244  YCII-related  52.69 
 
 		 94 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2489  YCII-related  52.69 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2391  YCII domain-containing protein  52.69 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1676  YCII domain-containing protein  52.69 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000604695  normal  0.185637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  51.04 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2620  YCII-related  52.75 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  48.42 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3299  YCII-related protein  50.54 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2373  YCII-related  44.21 
 
 		 96 aa  93.6  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  47.37 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  46.32 
 
 		 102 aa  92  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  48.39 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0757  YCII-related protein  45.36 
 
 		 100 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00179224  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1210  GTP cyclohydrolase II  48.78 
 
 		 92 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732067  normal  0.254823 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  48.35 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  40.66 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  45.05 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  43.96 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  43.96 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  43.96 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  43.96 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  43.96 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  43.96 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  43.96 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  43.96 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  40.62 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2510  YCII-related  37.23 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0553875  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  42.86 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31170  hypothetical protein  41.24 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.814554  normal  0.945113 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  39.08 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  39.08 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  43.96 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  41.76 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  41.18 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  40.66 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  40.66 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  39.56 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  37.37 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  40.66 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  40.66 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4873  hypothetical protein  34.44 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3292  hypothetical protein  34.44 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1762  YCII-related  31.51 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106659  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  39.33 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6318  hypothetical protein  34.62 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1511  hypothetical protein  34.62 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  35.56 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6976  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5356  hypothetical protein  34.74 
 
 		 352 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  34.48 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0660  hypothetical protein  30.23 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1877  hypothetical protein  32.56 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0139  YCII-like protein  30.86 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0970  YCII-related protein  27.84 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0987  hypothetical protein  30.16 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000944025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1351  hypothetical protein  29.07 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2720  hypothetical protein  29.76 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  34.72 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  35.71 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  32.35 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2002  YCII-related  28.57 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000615778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  31.33 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  35.71 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0094  YCII-related protein  37.1 
 
 		 107 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>