83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2620 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2620  YCII-related  100 
 
 
95 aa  194  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  48.42 
 
 
95 aa  103  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  52.63 
 
 
96 aa  100  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  53.93 
 
 
96 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0916  YCII-related  52.13 
 
 
95 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  52.13 
 
 
96 aa  97.1  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  53.93 
 
 
96 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  50.53 
 
 
97 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  50.53 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  52.75 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1911  YCII-related  50.53 
 
 
97 aa  94  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  50.56 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  50.56 
 
 
124 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1804  YCII-related  47.87 
 
 
110 aa  92  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0682479  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  48.91 
 
 
96 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  47.37 
 
 
95 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  47.25 
 
 
94 aa  89.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  47.83 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  48.31 
 
 
96 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  41.05 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  50 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  50 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  50 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1926  YCII-related  50.55 
 
 
92 aa  87  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3244  YCII-related  48.24 
 
 
94 aa  87  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  48.86 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  48.86 
 
 
96 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  48.86 
 
 
96 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  48.24 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2457  hypothetical protein  51.58 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2107  YCII-related  56.52 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.951624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1883  YCII-related  45.68 
 
 
94 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113856  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  46.59 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2373  YCII-related  43.18 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1871  YCII-related  55.07 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1210  GTP cyclohydrolase II  47.31 
 
 
92 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732067  normal  0.254823 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3299  YCII-related protein  46.34 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  34.74 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2391  YCII domain-containing protein  44.71 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2489  YCII-related  44.71 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1676  YCII domain-containing protein  44.71 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000604695  normal  0.185637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0757  YCII-related protein  46.15 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00179224  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  45.65 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2510  YCII-related  40.43 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  40 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  41.76 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4873  hypothetical protein  38.82 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3292  hypothetical protein  38.82 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  43.02 
 
 
105 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  43.02 
 
 
105 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  39.56 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31170  hypothetical protein  43.96 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.814554  normal  0.945113 
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  40.7 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  41.18 
 
 
96 aa  60.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  34.88 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6976  hypothetical protein  34.09 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6318  hypothetical protein  34.12 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1511  hypothetical protein  34.12 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0388  hypothetical protein  34.12 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0139  YCII-like protein  36.14 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1762  YCII-related  33.33 
 
 
95 aa  50.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106659  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0660  hypothetical protein  31.4 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  28.57 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  37.18 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5356  hypothetical protein  38.46 
 
 
352 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  29.59 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2720  hypothetical protein  30.59 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  37.5 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1417  hypothetical protein  30.56 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000127733 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1351  hypothetical protein  29.07 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  28.24 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  35.38 
 
 
97 aa  40.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1818  YCII-related protein  33.71 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344774  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1884  YCII-related  33.71 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.536807  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1837  YCII-related  33.71 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0987  hypothetical protein  29.17 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000944025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>