61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0957 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  100 
 
 		 102 aa  210  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  68.63 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  66.67 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2720  hypothetical protein  64.71 
 
 		 102 aa  140  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0388  hypothetical protein  45.1 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6976  hypothetical protein  38.24 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6318  hypothetical protein  38.24 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1511  hypothetical protein  38.24 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3292  hypothetical protein  38.24 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4873  hypothetical protein  38.24 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  40.48 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  34.62 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3244  YCII-related  30 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  37.33 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  28.21 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  28.89 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0660  hypothetical protein  32.53 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  33.71 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  33.33 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1351  hypothetical protein  28.89 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  33.77 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  33.85 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  33.85 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  38.36 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  37.33 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  34.18 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1210  GTP cyclohydrolase II  29.21 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732067  normal  0.254823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  28.28 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  29.35 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  28.28 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  31.94 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  29.27 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1746  YCII-related  29.49 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.333577  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  33.78 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2373  YCII-related  24.44 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  27.72 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1417  hypothetical protein  23.46 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  27.38 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  28.75 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  29.73 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  29.73 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  29.73 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  29.73 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  26.19 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  29.73 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  29.73 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  28.77 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  29.73 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  29.73 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2620  YCII-related  28.24 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  28.77 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  24.14 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  27.4 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  27.4 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  27.5 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  25.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  25.56 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  36.51 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  27.91 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  28.74 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1883  YCII-related  25.56 
 
 		 94 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113856  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>