45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1250 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  100 
 
 		 127 aa  255  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  59.57 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  47.87 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  45.16 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  42.71 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  42.39 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  40 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  41.94 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  41.24 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  42.71 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  42.39 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4142  YCII-related  40.22 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02200  hypothetical protein  44.57 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  32.97 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  36.46 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  38.46 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  33.33 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  32.14 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  32.58 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  38.67 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 		 181 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  32.18 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  38.36 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  33.78 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1926  YCII-related  34.67 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2201  YciI-like protein  34.33 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.187496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  35.71 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2457  hypothetical protein  37.14 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  35.71 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1871  YCII-related  35.71 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  35.71 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  30.23 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2107  YCII-related  35.71 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.951624 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0345  hypothetical protein  36.14 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  31.08 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  29.21 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  33.33 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  34.25 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  34.67 
 
 		 90 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1804  YCII-related  32.93 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0682479  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  32.18 
 
 		 89 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  34.67 
 
 		 90 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  37.84 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  38.67 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  30.67 
 
 		 90 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>