51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1517 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  100 
 
 		 89 aa  186  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  70.79 
 
 		 89 aa  142  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  68.54 
 
 		 89 aa  141  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  67.42 
 
 		 89 aa  137  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2201  YciI-like protein  69.66 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.187496 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18181  YciI-like protein  58.43 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0640598 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0898  YciI-like protein  55.06 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06281  YciI-like protein  55.06 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0009  YciI-like protein  55.06 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05771  YciI-like protein  52.81 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0992  YciI-like protein  53.93 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0574  YciI-like protein  51.69 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.546238  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06391  YciI-like protein  48.31 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06001  YciI-like protein  47.19 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.23871  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06301  YciI-like protein  47.19 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  37.68 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  29.07 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  24.71 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  32.86 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  37.88 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  28.4 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  28.57 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  31.88 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  29.07 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  26.6 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  22.54 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  22.62 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003073  protein yciI  29.17 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307697  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  29.21 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  23.94 
 
 		 92 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  23.6 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  27.55 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  27.08 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  27.55 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  29.21 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  27.08 
 
 		 98 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  27.08 
 
 		 98 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  27.08 
 
 		 98 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  27.08 
 
 		 98 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  27.08 
 
 		 98 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  27.55 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  22.54 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  24.18 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  26.04 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  23.53 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  23.68 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  25 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  23.68 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  23.68 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1306  YciI-like protein  27.08 
 
 		 98 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000114962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>