94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0898 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0898  YciI-like protein  100 
 
 		 89 aa  186  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18181  YciI-like protein  76.4 
 
 		 89 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0640598 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0992  YciI-like protein  73.03 
 
 		 89 aa  148  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05771  YciI-like protein  60.67 
 
 		 89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06281  YciI-like protein  61.8 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0009  YciI-like protein  60.67 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  57.3 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  55.06 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06391  YciI-like protein  47.19 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06001  YciI-like protein  51.69 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.23871  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0574  YciI-like protein  50.56 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.546238  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06301  YciI-like protein  50.56 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2201  YciI-like protein  55.06 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.187496 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  55.06 
 
 		 89 aa  110  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  52.81 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  31.25 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1987  YciI-like protein  31.58 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000630595 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06080  hypothetical protein  32.98 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  32.29 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  32.29 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  32.29 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  32.29 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  32.29 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1975  YciI-like protein  29.47 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1699  YciI-like protein  29.47 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2684  YCII-related  30.21 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.112307  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  31.25 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  31.25 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  31.25 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  31.25 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  31.25 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  31.25 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  31.25 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  31.25 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  28.72 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  28.42 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  31.52 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  31.25 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  31.52 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  31.58 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  29.35 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  29.17 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  29.17 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  29.17 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  31.52 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  30.85 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  30.43 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  28.26 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  27.08 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1145  YciI-like protein  28.26 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1306  YciI-like protein  31.25 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000114962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1945  YCII-related  28.12 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  30.21 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  28.26 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02770  YciI-like protein  30.21 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003073  protein yciI  30.21 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  28.05 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  31.76 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  30.43 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  28.72 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  26.83 
 
 		 92 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1485  YciI-like protein  28.72 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00728644  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  26.83 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2261  YciI-like protein  28.26 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  28.26 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  30.43 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4502  YciI-like protein  27.66 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  28.26 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1410  YciI-like protein  27.66 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0448344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2138  YciI-like protein  29.35 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1645  hypothetical protein  29.59 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.290819  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0666  YCII-related domain protein  28.12 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3036  YciI-like protein  26.09 
 
 		 99 aa  42  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  28.24 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1504  YciI-like protein  26.09 
 
 		 99 aa  42  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1421  YciI-like protein  30.43 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1514  YciI-like protein  26.09 
 
 		 99 aa  42  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00336778  normal  0.766184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  27.66 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  25 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0815  YCII-related  28.12 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1448  YciI-like protein  26.09 
 
 		 99 aa  42  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  29.67 
 
 		 96 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  29.35 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  28.05 
 
 		 100 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1459  YCII-related protein  25 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1466  YciI-like protein  28.26 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00060378  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2417  YciI-like protein  26.09 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.384464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  28.4 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  29.17 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3398  YCII-related  28.12 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000326779  normal  0.427283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2926  YciI-like protein  29.35 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  27.91 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1669  YciI-like protein  28.26 
 
 		 99 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000851056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  28.26 
 
 		 100 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>