78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0992 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0992  YciI-like protein  100 
 
 
89 aa  185  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18181  YciI-like protein  78.65 
 
 
89 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0640598 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0898  YciI-like protein  73.03 
 
 
89 aa  148  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05771  YciI-like protein  61.8 
 
 
89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06281  YciI-like protein  56.18 
 
 
89 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0009  YciI-like protein  56.18 
 
 
89 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0574  YciI-like protein  55.06 
 
 
89 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.546238  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06001  YciI-like protein  52.81 
 
 
89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.23871  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  58.43 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06391  YciI-like protein  50.56 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06301  YciI-like protein  49.44 
 
 
89 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  53.93 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2201  YciI-like protein  55.06 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.187496 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  53.93 
 
 
89 aa  104  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  49.44 
 
 
89 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  35.42 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  32.29 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  32.29 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  32.29 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1945  YCII-related  32.29 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  32.29 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  32.29 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1994  YCII-related protein  31.25 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2684  YCII-related  32.29 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.112307  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  32.29 
 
 
98 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  32.29 
 
 
98 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  32.29 
 
 
98 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  32.29 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  32.29 
 
 
98 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  32.29 
 
 
98 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  32.29 
 
 
98 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  32.29 
 
 
98 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  32.29 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  32.29 
 
 
98 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  31.25 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1459  YCII-related protein  28.12 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  31.25 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  31.25 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  31.25 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  31.25 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2688  YCII-related  31.52 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003073  protein yciI  31.25 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307697  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1975  YciI-like protein  27.37 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  30.49 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  32.97 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  30.43 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1699  YciI-like protein  27.37 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  30.49 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  30.43 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06080  hypothetical protein  29.79 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  30.59 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  32.43 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  29.35 
 
 
99 aa  42  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  29.79 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0666  YCII-related domain protein  30.21 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  27.17 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1306  YciI-like protein  30.21 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000114962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0815  YCII-related  30.21 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2261  YciI-like protein  29.35 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  30.49 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  32.43 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  32.53 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  32.43 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  31.58 
 
 
92 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1987  YciI-like protein  29.03 
 
 
100 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000630595 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02770  YciI-like protein  29.17 
 
 
98 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  28.72 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  30.43 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3398  YCII-related  28.12 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000326779  normal  0.427283 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  30.43 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  27.66 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  27.37 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1421  YciI-like protein  30.43 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1448  YciI-like protein  27.17 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127682  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3036  YciI-like protein  27.17 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1514  YciI-like protein  27.17 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00336778  normal  0.766184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  34.07 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1504  YciI-like protein  27.17 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244911  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>