66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0544 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  100 
 
 		 89 aa  185  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  68.54 
 
 		 89 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  69.66 
 
 		 89 aa  137  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  67.42 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2201  YciI-like protein  69.66 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.187496 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18181  YciI-like protein  58.43 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0640598 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0992  YciI-like protein  58.43 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0898  YciI-like protein  57.3 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0009  YciI-like protein  53.93 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06281  YciI-like protein  52.81 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05771  YciI-like protein  52.81 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0574  YciI-like protein  46.07 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.546238  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06301  YciI-like protein  47.19 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06001  YciI-like protein  48.31 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.23871  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06391  YciI-like protein  43.82 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  38.27 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  36.47 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  32.89 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  39.39 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  34.21 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  34.21 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  34.21 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  34.21 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  33.72 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  30.49 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  31.71 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1641  YciI-like protein  34.21 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  32.29 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  30.21 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  30.21 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  30.49 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  30.21 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  30.21 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  30.21 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  30.21 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  30.21 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  30.21 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  30.21 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  30.21 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  30.21 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  30.21 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  30.21 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  30.21 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  33.73 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06080  hypothetical protein  25.25 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  30.21 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5012  YciI-like protein  34.21 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  30.21 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1540  YciI-like protein  31.58 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  33.33 
 
 		 94 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  32.18 
 
 		 127 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1945  YCII-related  27.08 
 
 		 98 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08150  hypothetical protein  31.25 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  32.53 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  30.49 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  31.52 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  32.86 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  27.17 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  30.68 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003073  protein yciI  30.21 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  28.12 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  28.24 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  30.21 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  34.29 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1975  YciI-like protein  25.26 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1952  YciI-like protein  31.33 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  0.569612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>