78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4011 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  100 
 
 
96 aa  192  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  40.79 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1746  YCII-related  42.65 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.333577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1599  hypothetical protein  38.16 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.32365  normal  0.712255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0886  hypothetical protein  38.16 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1263  YCII-related  36.84 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  36.84 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  38.46 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3667  YCII-like protein  34.67 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0968  YCII-related  37.33 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0868202 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  32.14 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  34.48 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00344  hypothetical protein  39.47 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00356549  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  34.48 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  34.48 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1804  YCII-related  32.5 
 
 
110 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0682479  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  35.16 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  40.79 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  31.25 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  32.94 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  32 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  39.39 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4419  hypothetical protein  34.67 
 
 
88 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2257  YCII-related protein  34.85 
 
 
84 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  37.88 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  34.02 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  28.41 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  34.02 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  31.25 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31170  hypothetical protein  34.09 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.814554  normal  0.945113 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1911  YCII-related  32.18 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  26.37 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0139  YCII-like protein  38.03 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  37.31 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2510  YCII-related  31.11 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19541  hypothetical protein  28.38 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1871  YCII-related  37.31 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2002  YCII-related  26.25 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000615778  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  30.61 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  34.85 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  31.03 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0757  YCII-related protein  31.82 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00179224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  32.99 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2107  YCII-related  37.31 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.951624 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  32.89 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  30.14 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1079  hypothetical protein  28.38 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  30.43 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1605  hypothetical protein  20.93 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  31.58 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2722  YCII-related  38.71 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1926  YCII-related  35.82 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  32.89 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1112  hypothetical protein  24.73 
 
 
126 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  32.89 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  32.89 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  26.44 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  31.43 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  30.67 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  31.58 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2720  hypothetical protein  27.5 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  27.5 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0345  hypothetical protein  34.72 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  29.33 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  29.17 
 
 
90 aa  40.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0987  hypothetical protein  23.81 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000944025  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  32.91 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  32.91 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  32.91 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  32.91 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  32.91 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  32.91 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  27.78 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2201  YciI-like protein  34.85 
 
 
89 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.187496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  27.5 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  38.36 
 
 
99 aa  40  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2671  hypothetical protein  36.76 
 
 
79 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  32.91 
 
 
125 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>