43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2671 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2671  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1890  YciI-like protein  43.24 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1818  YciI-like protein  43.24 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0636505  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0972  YciI-like protein  40 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  36 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  40 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  36.99 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  34.25 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  30.86 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4138  YciI-like protein  36.71 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  30.86 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  32.1 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  33.8 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  36.36 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  36.36 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  31.82 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  30.77 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  29.63 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  41.3 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  28.4 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  35.71 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  33.33 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  30.49 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  42.59 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1098  hypothetical protein  32.14 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0115  YCII-related  40 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.011377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  37.33 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  40.74 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  30.14 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  40.74 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  38.89 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  30.38 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  30.99 
 
 		 97 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2851  YCII-related protein  35.38 
 
 		 97 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  28.79 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4142  YCII-related  34.62 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  35.62 
 
 		 100 aa  40.8  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1054  YciI-like protein  38.89 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1540  YciI-like protein  41.51 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  35.62 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  39.62 
 
 		 95 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5012  YciI-like protein  39.62 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  36.76 
 
 		 96 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>