111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0330 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  55.1 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3941  YciI-like protein  62.24 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0697626  normal  0.0807548 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4679  YciI-like protein  64.89 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189989  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  40.43 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  37.36 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  37.5 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  39.77 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  43.21 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1964  YciI-like protein  40 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2083  YCII-related protein  33.72 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7466  hypothetical protein  37.04 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  41.98 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  41.98 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  37.36 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  37.35 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  37.78 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  34.78 
 
 		 98 aa  57  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  34.44 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  38.27 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1115  YciI-like protein  30.86 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.176684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0115  YCII-related  42.86 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.011377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2851  YCII-related protein  38.3 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  36.36 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1645  hypothetical protein  34.69 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.290819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  35.8 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0094  YCII-related protein  31.71 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2417  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.384464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2926  YciI-like protein  35.42 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1716  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0718  YciI-like protein  34.04 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3036  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1448  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1514  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00336778  normal  0.766184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1504  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  33.68 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  35.42 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  32.29 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4138  YciI-like protein  32.91 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2138  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  32.65 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1233  YCII-related  30.21 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000791191  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  31.63 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2671  hypothetical protein  33.8 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2688  YCII-related  32.29 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  31.63 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  32.29 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2904  YCII-related  32.99 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.087124  normal  0.332831 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  34.38 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  34.41 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  35.42 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1421  YciI-like protein  32.29 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  40.28 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02770  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  29.59 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  34.38 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1890  YciI-like protein  36.67 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1818  YciI-like protein  36.67 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0636505  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1466  YciI-like protein  32.29 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00060378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2714  YciI-like protein  32.29 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0349915  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2736  YciI-like protein  32.29 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000268578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0972  YciI-like protein  36.67 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1669  YciI-like protein  31.25 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000851056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1639  YciI-like protein  32.63 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2815  YciI-like protein  32.29 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000129416  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1650  YciI-like protein  32.29 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239364  hitchhiker  0.0000000000431009 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  32.26 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1484  YCII-related  29.89 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4693  YCII-related  32.14 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4760  YCII-related  31.94 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0861081  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  31.25 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  28.57 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  31.25 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  29.59 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003073  protein yciI  27.55 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2835  YCII-related  28.12 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1269  YciI-like protein  28.57 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  26.97 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  28.12 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  31.51 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  27.66 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5729  YciI-like protein  30.43 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.714875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  31.25 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  29.17 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1508  YciI-like protein  31.94 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>