22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4760 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4760  YCII-related  100 
 
 
101 aa  208  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0861081  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  36.9 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4693  YCII-related  37.68 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  36.14 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  33.73 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  33.73 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7466  hypothetical protein  31.25 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  31.94 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  29.69 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  32.53 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  35.48 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  32.86 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  33.87 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4138  YciI-like protein  35 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  29.21 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1964  YciI-like protein  33.33 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268775  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  31.25 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  31.46 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2851  YCII-related protein  40.32 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  35 
 
 
90 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2083  YCII-related protein  26.92 
 
 
188 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0349  YCII-related  38.1 
 
 
93 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117394  normal  0.0868424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>