22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2083 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2083  YCII-related protein  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7466  hypothetical protein  41.49 
 
 		 181 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5879  YCII-related protein  34.16 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  38.37 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  33.72 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4138  YciI-like protein  36.71 
 
 		 100 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  34.07 
 
 		 96 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1964  YciI-like protein  36.47 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  33.33 
 
 		 97 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1115  YciI-like protein  31.25 
 
 		 101 aa  52  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.176684  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  34.15 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3941  YciI-like protein  36.05 
 
 		 98 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0697626  normal  0.0807548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  32.94 
 
 		 97 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5729  YciI-like protein  29.87 
 
 		 98 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.714875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  31.33 
 
 		 103 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  30.12 
 
 		 103 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  33.33 
 
 		 97 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2904  YCII-related  29.47 
 
 		 100 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.087124  normal  0.332831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  30.12 
 
 		 103 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  36.84 
 
 		 100 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  30.12 
 
 		 103 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  33.73 
 
 		 90 aa  41.6  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>