77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3941 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3941  YciI-like protein  100 
 
 		 98 aa  201  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0697626  normal  0.0807548 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  68.37 
 
 		 98 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  62.24 
 
 		 98 aa  130  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4679  YciI-like protein  65.31 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189989  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  38.3 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  38.27 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  37.5 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  42.86 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  40.48 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  34.07 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0115  YCII-related  46.15 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.011377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2083  YCII-related protein  36.05 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0094  YCII-related protein  34.07 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7466  hypothetical protein  33.71 
 
 		 181 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1645  hypothetical protein  35.71 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.290819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  29.55 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  33.71 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  37.63 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  33.33 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  33.33 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1484  YCII-related  35.96 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  34.57 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_004310  BR1890  YciI-like protein  37.78 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1818  YciI-like protein  37.78 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0636505  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  34.57 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  31.82 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  31.82 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  32.95 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0972  YciI-like protein  36.67 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1924  YciI-like protein  35.42 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22780  YciI-like protein  35.42 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.064842 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1269  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  30.68 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  41.33 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  30.68 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4142  YciI-like protein  34.02 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  32.97 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  30.68 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1508  YciI-like protein  33.33 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  37.37 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  31.63 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  30.61 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  34.38 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1964  YciI-like protein  33.33 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1945  YCII-related  31.63 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  30.68 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1716  YciI-like protein  34.38 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2671  hypothetical protein  33.8 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  27.55 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  27.55 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2904  YCII-related  32.99 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.087124  normal  0.332831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  27.55 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  33.33 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4760  YCII-related  33.82 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0861081  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  35 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  30.61 
 
 		 98 aa  42.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1115  YciI-like protein  23.81 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.176684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  30.53 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2138  YciI-like protein  28.12 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1098  hypothetical protein  31.03 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1987  YciI-like protein  32.56 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000630595 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02770  YciI-like protein  28.57 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4693  YCII-related  30.86 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2000  YCII-related  30 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1233  YCII-related  29.17 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000791191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  31.25 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  29.27 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0718  YciI-like protein  31.25 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  30.21 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  29.59 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  29.59 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  34.83 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  29.59 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>