142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5625 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  100 
 
 		 103 aa  214  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  77.67 
 
 		 103 aa  169  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  77.67 
 
 		 103 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  76.7 
 
 		 103 aa  167  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  76.7 
 
 		 103 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  76.7 
 
 		 103 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  76.7 
 
 		 103 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  65.35 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1098  hypothetical protein  54.64 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1484  YCII-related  48.98 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  40.4 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  39.58 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  36.46 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  36.46 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0972  YciI-like protein  39.18 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1890  YciI-like protein  40 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1818  YciI-like protein  40 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0636505  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  39.13 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4142  YciI-like protein  39.58 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  34.83 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  36.56 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  34.38 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  38.04 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  38.04 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  38.04 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  39.36 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  41.05 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  37.5 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1233  YCII-related  32.26 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000791191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  39.51 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0349  YCII-related  35.29 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117394  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1115  YciI-like protein  32.93 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.176684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  33.78 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1716  YciI-like protein  32.26 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  33.33 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  32.95 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  32.98 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2851  YCII-related protein  39.77 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  34.02 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2684  YCII-related  31.18 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.112307  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1645  hypothetical protein  32.26 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.290819  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4138  YciI-like protein  32.5 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1485  YciI-like protein  32.99 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00728644  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0718  YciI-like protein  30.85 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0115  YCII-related  35.48 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.011377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  32.99 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  32.1 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2671  hypothetical protein  32.1 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  35.16 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  26.88 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  28.72 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  33.33 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22780  YciI-like protein  32.99 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.064842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1924  YciI-like protein  32.99 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  27.66 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  27.66 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  27.66 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  30.93 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  26.6 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  31.96 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  36.25 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  29.59 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  25.53 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  30.11 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  31.82 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  30.11 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  30.11 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4502  YciI-like protein  29.9 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  32.95 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  30.11 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1410  YciI-like protein  29.9 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0448344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1987  YciI-like protein  25 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000630595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  30.11 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  29.03 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  34.67 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1145  YciI-like protein  28.12 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  30.11 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  30.11 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  30.11 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  31.96 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  32.26 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  28.72 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2000  YCII-related  31 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2261  YciI-like protein  28.72 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  32.63 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3398  YCII-related  27.96 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000326779  normal  0.427283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1964  YciI-like protein  33.72 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3036  YciI-like protein  30.21 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2904  YCII-related  26.8 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.087124  normal  0.332831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1448  YciI-like protein  30.21 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1514  YciI-like protein  30.21 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00336778  normal  0.766184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1504  YciI-like protein  30.21 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2138  YciI-like protein  29.79 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  32.26 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5729  YciI-like protein  30.77 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.714875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  29.03 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  32.63 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02770  YciI-like protein  26.6 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7466  hypothetical protein  27.96 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2417  YciI-like protein  29.17 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.384464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>