119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5217 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  100 
 
 		 103 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  99.03 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  95.15 
 
 		 103 aa  201  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  90.29 
 
 		 103 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  89.32 
 
 		 103 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  89.32 
 
 		 103 aa  191  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  76.7 
 
 		 103 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  60 
 
 		 103 aa  123  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1098  hypothetical protein  54.64 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1484  YCII-related  48.98 
 
 		 99 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  36.08 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  38.14 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  34.02 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  34.02 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4142  YciI-like protein  39.18 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  35.11 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  40.62 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  37.23 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  34.09 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1890  YciI-like protein  38.54 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1818  YciI-like protein  38.54 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0636505  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0972  YciI-like protein  37.76 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  35.96 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  40.74 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  37.11 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  34.78 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  32.58 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  32.61 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  32.61 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  34.04 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  29.59 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0094  YCII-related protein  32.32 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  36.36 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0115  YCII-related  34.04 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.011377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0349  YCII-related  31.4 
 
 		 93 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117394  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  31.63 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  29.79 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  30.61 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2000  YCII-related  31.96 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  29.55 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4138  YciI-like protein  26.74 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  31.91 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  37.33 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  30.61 
 
 		 99 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  30.85 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  26.6 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  34.25 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1485  YciI-like protein  29.59 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00728644  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1233  YCII-related  26.6 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000791191  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  28.72 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  36.47 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1716  YciI-like protein  29.79 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1645  hypothetical protein  28.72 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.290819  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1699  YciI-like protein  26.6 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0898  YciI-like protein  31.52 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  36.25 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22780  YciI-like protein  29.59 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.064842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1924  YciI-like protein  29.59 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1964  YciI-like protein  32.94 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  35.9 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  26.6 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2904  YCII-related  26.53 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.087124  normal  0.332831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  34 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1987  YciI-like protein  25.56 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000630595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1975  YciI-like protein  25.53 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  32.5 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  28.57 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5729  YciI-like protein  26.67 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.714875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  29.79 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1115  YciI-like protein  28.92 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.176684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  29.79 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  26.53 
 
 		 192 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0718  YciI-like protein  26.6 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7466  hypothetical protein  29.79 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  36.25 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  36.25 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  36.25 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  31.58 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2671  hypothetical protein  30.49 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2851  YCII-related protein  36.36 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4502  YciI-like protein  27.55 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  31.58 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  23.4 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  31.63 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18181  YciI-like protein  29.35 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0640598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1410  YciI-like protein  27.55 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0448344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1641  YciI-like protein  33.75 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  29.79 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  30.53 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1540  YciI-like protein  36.25 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  31.18 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  33.78 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  25.53 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  25.53 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  24.47 
 
 		 98 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  25.53 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  25.53 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  30.68 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1145  YciI-like protein  23.4 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>