83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8035 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  100 
 
 		 94 aa  191  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  58.7 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  47.78 
 
 		 97 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  45.56 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  45.26 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  45.16 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  45.74 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  41.49 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  44.68 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  36.36 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  39.13 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  36.26 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  34.78 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4142  YCII-related  43.96 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  36.05 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0565  YCII-related protein  36.49 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  26.97 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2510  YCII-related  35.48 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  37.78 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  30.86 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1263  YCII-related  33.33 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  30.49 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  32.65 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  31.51 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  29.41 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  30.14 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  31.67 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  33.73 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  29.27 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  30.49 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1508  YciI-like protein  34.67 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  28.57 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  31.88 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  35.29 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  32.53 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  28.57 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  27.06 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  30.49 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  29.27 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  28.92 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  31.63 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  28.92 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  31.63 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  29.27 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  31.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  31.51 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  30.61 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  31.33 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  36.84 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  31.33 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  31.91 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  30.77 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  30.85 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1762  YCII-related  30.56 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106659  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  33.73 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  34.94 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31170  hypothetical protein  36.59 
 
 		 99 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.814554  normal  0.945113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0388  hypothetical protein  29.41 
 
 		 102 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  39.74 
 
 		 97 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  34.94 
 
 		 97 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  31.33 
 
 		 99 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  31.51 
 
 		 115 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  25.29 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3667  YCII-like protein  28.17 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  29.27 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0139  YCII-like protein  32.39 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  30.49 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1952  YciI-like protein  36 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  0.569612 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  29.55 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  32.89 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  27.91 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  28.72 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  30.49 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  32.53 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  29.59 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  28.72 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  28.72 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  28.72 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  28.72 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  30.85 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  27.78 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  28.41 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  30.85 
 
 		 98 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>