67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2195 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  100 
 
 		 94 aa  194  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  45.16 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  38.89 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  36.67 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  40.21 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  40.21 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  38.95 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  38.3 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  34.78 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  32.61 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  36.46 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1484  YCII-related  37.93 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  32.97 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  38.04 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0565  YCII-related protein  32.95 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1100  YciI-like protein  35.63 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  34.12 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  36.36 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  36.36 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  35.23 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  35.23 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  32.94 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  29.79 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  35.23 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  34.78 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0388  hypothetical protein  32.47 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  34.18 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  29.89 
 
 		 181 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  36.23 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  34.09 
 
 		 103 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  28.26 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  32.95 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  30.77 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2000  YCII-related  31.18 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1098  hypothetical protein  34.04 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02200  hypothetical protein  44.57 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  28.57 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  30.11 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  27.47 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  29.89 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  30.95 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  28.74 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2720  hypothetical protein  28.09 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  29.89 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4873  hypothetical protein  34.72 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3292  hypothetical protein  34.72 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  32.97 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  31.87 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  33.7 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  26.19 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  27.96 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  34.41 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  29.35 
 
 		 100 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  28.57 
 
 		 97 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1746  YCII-related  36.84 
 
 		 92 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.333577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  26.44 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  28.57 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  26.09 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  33.33 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  41.67 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  34.52 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  28.57 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  30.77 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  29.87 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  28.57 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  34.52 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  33.78 
 
 		 94 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>