152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5221 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  100 
 
 		 97 aa  196  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  38.64 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  45.83 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  33.33 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  36.36 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0565  YCII-related protein  41.25 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  33.73 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1945  YCII-related  37.89 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  45.21 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  43.24 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  36.26 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  33.73 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  32.97 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  43.06 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  35.64 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  36.26 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  36.26 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  39.8 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  36.78 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2684  YCII-related  39.08 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.112307  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  36.78 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  36.78 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1994  YCII-related protein  39.74 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1650  YciI-like protein  38.89 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239364  hitchhiker  0.0000000000431009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2714  YciI-like protein  38.89 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0349915  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2736  YciI-like protein  38.89 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000268578  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2815  YciI-like protein  38.89 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000129416  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  39.08 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  38.1 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1639  YciI-like protein  36.78 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2261  YciI-like protein  37.93 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  32.14 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  38.46 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3398  YCII-related  40 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000326779  normal  0.427283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  32.58 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  41.1 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  33.33 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  41.1 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  34.12 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  35.62 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  36.25 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  33.33 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  37.76 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  39.73 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  39.73 
 
 		 90 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  38.1 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1645  hypothetical protein  35.9 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.290819  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3036  YciI-like protein  37.93 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  38.46 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  35.62 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1448  YciI-like protein  37.93 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1514  YciI-like protein  37.93 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00336778  normal  0.766184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1504  YciI-like protein  37.93 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  42.17 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  32.65 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  36.9 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  40.96 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  33.77 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22780  YciI-like protein  38.1 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.064842 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  34.25 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  35 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1306  YciI-like protein  35.79 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000114962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1924  YciI-like protein  38.1 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  34.15 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  31.96 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003073  protein yciI  33.33 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2926  YciI-like protein  36.78 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  34.25 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  32.1 
 
 		 103 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  30.68 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2417  YciI-like protein  36.78 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.384464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  41.67 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02770  YciI-like protein  32.63 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4142  YciI-like protein  39.36 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2138  YciI-like protein  35.56 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  39.19 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  24.69 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4502  YciI-like protein  36.73 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  32.61 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  32.61 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1410  YciI-like protein  36.73 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0448344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1669  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000851056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  32.61 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1485  YciI-like protein  39.76 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00728644  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  31.52 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  34.25 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  35.71 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  34.25 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2851  YCII-related protein  41.1 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1263  YCII-related  29.85 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  35.71 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1421  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  33.33 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  35.71 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  33.33 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  33.33 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  33.33 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  33.33 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  35.62 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>