36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2893 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  100 
 
 		 100 aa  199  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  48.94 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  50.54 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  45.56 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  44.71 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  42.39 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  41.76 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  40.66 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  33.33 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4142  YCII-related  39.36 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  36.26 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  35.56 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  37.36 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  35.42 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  32.97 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  37.33 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02200  hypothetical protein  40.66 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0388  hypothetical protein  32.89 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  32.86 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2720  hypothetical protein  30.67 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  35.62 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  35.62 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0565  YCII-related protein  31.4 
 
 		 86 aa  43.5  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799624 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  28.57 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  29.41 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  34.25 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18181  YciI-like protein  31.88 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0640598 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  31.82 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  28.57 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  30.49 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  32.88 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  29.41 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1746  YCII-related  38.46 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.333577  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  32.88 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  32.88 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0139  YCII-like protein  34.67 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>