68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2720 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2720  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  209  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  64.71 
 
 		 102 aa  140  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  60.78 
 
 		 102 aa  130  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  60.78 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0388  hypothetical protein  44.79 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6976  hypothetical protein  40.4 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4873  hypothetical protein  43.43 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3292  hypothetical protein  43.43 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6318  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1511  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  38.1 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  33 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  33 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  32.58 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  29.76 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  38.67 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  28.89 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  30 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3244  YCII-related  30.43 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  28.4 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  37.33 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1883  YCII-related  32.35 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113856  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0757  YCII-related protein  28.57 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00179224  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1210  GTP cyclohydrolase II  32.93 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732067  normal  0.254823 
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  28.42 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  29.76 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2620  YCII-related  30.59 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  30.95 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  29.76 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  30.67 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1804  YCII-related  28.57 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0682479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  29.76 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  24.69 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  26.14 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1926  YCII-related  34.67 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  34.85 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  28.36 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  28.57 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  26.37 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2107  YCII-related  37.14 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.951624 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  27.47 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  26.09 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  29.73 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  27.47 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  29.73 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  28.09 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0660  hypothetical protein  32.53 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  29.73 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  35.38 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  29.73 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  29.73 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  29.73 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  29.73 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  29.73 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1351  hypothetical protein  28.89 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  27.54 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31170  hypothetical protein  24.36 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.814554  normal  0.945113 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1911  YCII-related  28.09 
 
 		 97 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  34.69 
 
 		 105 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  26.37 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  27.5 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  22.99 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1871  YCII-related  35.71 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0916  YCII-related  32.84 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  30.43 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3299  YCII-related protein  30.86 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1417  hypothetical protein  23.46 
 
 		 100 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127733 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  27.96 
 
 		 95 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>