86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2508 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  100 
 
 		 96 aa  194  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0916  YCII-related  50 
 
 		 95 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263872 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  49.46 
 
 		 97 aa  90.5  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  48.39 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  48.39 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  45.74 
 
 		 94 aa  87.8  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1911  YCII-related  49.46 
 
 		 97 aa  87.8  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  43.75 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  47.78 
 
 		 96 aa  84.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1804  YCII-related  41.49 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0682479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1883  YCII-related  42.71 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113856  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  41.67 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2489  YCII-related  46.88 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1676  YCII domain-containing protein  46.88 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000604695  normal  0.185637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  51.19 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2391  YCII domain-containing protein  46.88 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3299  YCII-related protein  44.68 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3244  YCII-related  41.94 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  42.39 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  42.39 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  43.01 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  40.22 
 
 		 96 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  39.13 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  39.13 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  39.13 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1926  YCII-related  43.01 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2457  hypothetical protein  46.24 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  38.04 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1871  YCII-related  45.16 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2107  YCII-related  45.16 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.951624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  41.67 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  38.55 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  41.11 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  38.55 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  36.96 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  36.96 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  36.96 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  36.96 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  36.96 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  36.96 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  36.96 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  35.87 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  37.65 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  35.87 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  38.04 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  38.04 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1210  GTP cyclohydrolase II  37.8 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732067  normal  0.254823 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2373  YCII-related  35.56 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2620  YCII-related  41.18 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2510  YCII-related  35.37 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  41.03 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0660  hypothetical protein  31.58 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  34.04 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  30.12 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1351  hypothetical protein  32.98 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  32.56 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1762  YCII-related  27.08 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106659  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31170  hypothetical protein  34.52 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.814554  normal  0.945113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  30.21 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0757  YCII-related protein  34.48 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00179224  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0987  hypothetical protein  38.33 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000944025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  28.89 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1417  hypothetical protein  38.1 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4873  hypothetical protein  31.11 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3292  hypothetical protein  31.11 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6976  hypothetical protein  26.67 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2002  YCII-related  29.73 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000615778  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6318  hypothetical protein  26.67 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1511  hypothetical protein  26.67 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  35.14 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2015  hypothetical protein  29.49 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1877  hypothetical protein  30.95 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  38.27 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  26.67 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0970  YCII-related protein  28.28 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  30.56 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2720  hypothetical protein  26.14 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  33.71 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0388  hypothetical protein  27.78 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  32.43 
 
 		 88 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  29.76 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  31.46 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  25.81 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  25.26 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1605  hypothetical protein  18.39 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17171  hypothetical protein  18.18 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>