23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1605 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1605  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17051  hypothetical protein  86.6 
 
 
99 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17171  hypothetical protein  83.51 
 
 
97 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321834  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16931  hypothetical protein  71.13 
 
 
100 aa  145  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.476637  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2015  hypothetical protein  40.43 
 
 
102 aa  87.8  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  41.49 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19541  hypothetical protein  44.33 
 
 
108 aa  84.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1079  hypothetical protein  43.3 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23561  hypothetical protein  39.36 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.202384 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0327  hypothetical protein  38.3 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3667  YCII-like protein  27.17 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  25.81 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0886  hypothetical protein  32.61 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1599  hypothetical protein  30.43 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.32365  normal  0.712255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1263  YCII-related  31.88 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  22.35 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  26.88 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  26.88 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  20.93 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2257  YCII-related protein  30.77 
 
 
84 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  27.03 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  18.39 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  25 
 
 
94 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>