26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0886 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0886  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  180  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1263  YCII-related  76.14 
 
 
88 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  75 
 
 
88 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1599  hypothetical protein  71.59 
 
 
88 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.32365  normal  0.712255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3667  YCII-like protein  68.18 
 
 
88 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  63.64 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4419  hypothetical protein  63.64 
 
 
88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  38.16 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  42.03 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2015  hypothetical protein  31.18 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1079  hypothetical protein  34.74 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19541  hypothetical protein  34.74 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17051  hypothetical protein  33.7 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23561  hypothetical protein  34.41 
 
 
102 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.202384 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1605  hypothetical protein  32.61 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16931  hypothetical protein  32.86 
 
 
100 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.476637  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17171  hypothetical protein  31.52 
 
 
97 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321834  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0327  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  31.34 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  31.34 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  31.82 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00344  hypothetical protein  32.84 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00356549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  25 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  31.34 
 
 
115 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  32.26 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2257  YCII-related protein  28.57 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>