22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4419 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4419  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3667  YCII-like protein  71.59 
 
 
88 aa  137  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1599  hypothetical protein  63.64 
 
 
88 aa  131  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.32365  normal  0.712255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0886  hypothetical protein  63.64 
 
 
88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  63.64 
 
 
88 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1263  YCII-related  61.36 
 
 
88 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  59.77 
 
 
97 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  34.67 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2015  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  52.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19541  hypothetical protein  31.18 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1079  hypothetical protein  31.18 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0327  hypothetical protein  37.63 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1746  YCII-related  29.85 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.333577  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17051  hypothetical protein  28.26 
 
 
99 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16931  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.476637  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17171  hypothetical protein  26.09 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321834  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  32.84 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  31.88 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1605  hypothetical protein  26.09 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  32.88 
 
 
103 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  28.17 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>