49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1746 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1746  YCII-related  100 
 
 		 92 aa  191  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.333577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  42.65 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0081  YCII-related  38.89 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  37.29 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  33.33 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2722  YCII-related  35.29 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  32.94 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4502  YciI-like protein  38.71 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1410  YciI-like protein  38.71 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0448344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  37.21 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  28.36 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1716  YciI-like protein  35.53 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1233  YCII-related  30.86 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000791191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  37.1 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1263  YCII-related  32.86 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  29.49 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3667  YCII-like protein  29.85 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0655  YCII-related  33.85 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.622493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1599  hypothetical protein  28.36 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.32365  normal  0.712255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  30.86 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  40.68 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1994  YCII-related protein  36.71 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0139  YCII-like protein  32.47 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  35.09 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  37.1 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2205  hypothetical protein  36.51 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.872222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  32.05 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00344  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00356549  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  30.77 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  37.1 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22780  YciI-like protein  30.95 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.064842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1924  YciI-like protein  30.95 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914031  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0345  hypothetical protein  32.26 
 
 		 102 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  36.84 
 
 		 94 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0662  YCII-related  32.31 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  32.89 
 
 		 99 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0675  YCII-related  32.31 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  34.38 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  34.92 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  28.95 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1485  YciI-like protein  35.48 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00728644  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  38.71 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  38.46 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1134  hypothetical protein  35.62 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  31.75 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0968  YCII-related  34.72 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0868202 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2257  YCII-related protein  29.69 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  33.33 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17051  hypothetical protein  25.29 
 
 		 99 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>