17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0675 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0662  YCII-related  100 
 
 
95 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0675  YCII-related  100 
 
 
95 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0655  YCII-related  98.95 
 
 
95 aa  190  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.622493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0081  YCII-related  71.58 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2205  hypothetical protein  40.66 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.872222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4066  hypothetical protein  38.2 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2165  YCII-related  41.57 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.0780473 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2366  YCII-related protein  34.88 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1127  YCII-related  40.51 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238698  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3217  hypothetical protein  32.26 
 
 
98 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4943  hypothetical protein  32.26 
 
 
98 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3969  YCII-related  35.53 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533429  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0157  YCII-related  35.56 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3680  YCII-related protein  37.93 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0923  YCII-related  35.9 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1746  YCII-related  32.31 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.333577  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  33.85 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>