16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3680 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3680  YCII-related protein  100 
 
 		 102 aa  204  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3969  YCII-related  92.16 
 
 		 102 aa  190  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1127  YCII-related  45.36 
 
 		 109 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2165  YCII-related  48.45 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.0780473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0923  YCII-related  53.06 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0157  YCII-related  52.04 
 
 		 113 aa  84.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2205  hypothetical protein  38.04 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.872222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0081  YCII-related  38.2 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0655  YCII-related  34.18 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.622493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4943  hypothetical protein  28.57 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0662  YCII-related  34.21 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0675  YCII-related  34.21 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4066  hypothetical protein  29.76 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2366  YCII-related protein  28.57 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  32.43 
 
 		 97 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>