20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2366 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2366  YCII-related protein  100 
 
 		 98 aa  205  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4066  hypothetical protein  65.98 
 
 		 97 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177405  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4943  hypothetical protein  65.62 
 
 		 98 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3217  hypothetical protein  65.62 
 
 		 98 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1127  YCII-related  37.5 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2165  YCII-related  36.9 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.0780473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0655  YCII-related  36.05 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.622493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2205  hypothetical protein  35.16 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.872222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0081  YCII-related  33.72 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0675  YCII-related  34.88 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0662  YCII-related  34.88 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0157  YCII-related  35.79 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3969  YCII-related  28.57 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0923  YCII-related  34.69 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3680  YCII-related protein  28.57 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  31.34 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  34.33 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  37.04 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  32.84 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  34.43 
 
 		 96 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>