16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4066 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4066  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  204  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2366  YCII-related protein  65.98 
 
 		 98 aa  149  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4943  hypothetical protein  67.71 
 
 		 98 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3217  hypothetical protein  67.71 
 
 		 98 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2165  YCII-related  42.86 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.0780473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0655  YCII-related  39.33 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.622493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1127  YCII-related  36.46 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238698  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0662  YCII-related  38.2 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0675  YCII-related  38.2 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2205  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.872222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0081  YCII-related  37.36 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0157  YCII-related  34.69 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3969  YCII-related  27.38 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3680  YCII-related protein  29.76 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0923  YCII-related  31.76 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  36.07 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>