15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0923 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0923  YCII-related  100 
 
 
99 aa  196  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3969  YCII-related  51.02 
 
 
102 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533429  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0157  YCII-related  56.57 
 
 
113 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3680  YCII-related protein  53.06 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2165  YCII-related  47.47 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.0780473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1127  YCII-related  46.46 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238698  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2205  hypothetical protein  36.96 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.872222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0081  YCII-related  41.03 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2366  YCII-related protein  34.69 
 
 
98 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4066  hypothetical protein  32.14 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0662  YCII-related  35.9 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0675  YCII-related  35.9 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0655  YCII-related  35.9 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.622493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4943  hypothetical protein  30.95 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3217  hypothetical protein  30.95 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>