157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6921 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  100 
 
 		 95 aa  184  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  58.7 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  51.11 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  45.56 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  45.35 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  44.09 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  44.79 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  44.57 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  38.64 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  41.94 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  32.58 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0565  YCII-related protein  41.67 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  39.78 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  40.43 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4142  YCII-related  43.33 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  35.42 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  39.19 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  37.68 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  39.19 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  40.96 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  36.47 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  37.65 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1306  YciI-like protein  40.96 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000114962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  42.17 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  39.76 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  38.04 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1945  YCII-related  37.93 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  35.79 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  39.76 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  35.79 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1098  hypothetical protein  41.03 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  35.79 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  35.79 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  35.79 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  36.14 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  35.37 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  43.55 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  34.74 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  43.55 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18181  YciI-like protein  32.94 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0640598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1994  YCII-related protein  34.74 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  40.54 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  35.79 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02770  YciI-like protein  36.14 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  32.93 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  35.79 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  35.79 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  35.79 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  35.79 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  35.79 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  35.79 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  35.79 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  35.79 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  36.14 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  36.14 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  36 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1466  YciI-like protein  39.76 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00060378  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003073  protein yciI  36.14 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307697  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  36.59 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  34 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  36.47 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  34.67 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2138  YciI-like protein  39.76 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  36.59 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  36 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  38.55 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  37.93 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06391  YciI-like protein  30.59 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  35 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2926  YciI-like protein  38.55 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3036  YciI-like protein  41.86 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  37.35 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1448  YciI-like protein  41.86 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1514  YciI-like protein  41.86 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00336778  normal  0.766184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22780  YciI-like protein  37.21 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.064842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1504  YciI-like protein  41.86 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2261  YciI-like protein  37.35 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1924  YciI-like protein  37.21 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914031  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  37.35 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2201  YciI-like protein  36.23 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.187496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  38.27 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  38.1 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  36.25 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  36.59 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  33.68 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2417  YciI-like protein  40.7 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.384464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  36.59 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  32.53 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  32.53 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  32.53 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  34 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1233  YCII-related  36.59 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000791191  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0574  YciI-like protein  28.24 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.546238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1508  YciI-like protein  37.5 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  34 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2684  YCII-related  32.63 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.112307  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05771  YciI-like protein  28.24 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  35.48 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1459  YCII-related protein  32.94 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  34.94 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>