38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2658 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  100 
 
 		 133 aa  263  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1746  YCII-related  33.33 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.333577  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  35.56 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2076  YCII domain-containing protein  28.23 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000637229  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  31.82 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4444  YCII-related  35.38 
 
 		 286 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0302948  normal  0.210377 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0081  YCII-related  37.31 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1725  hypothetical protein  27.34 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.084277  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1943  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0106441  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2968  YCII-related protein  24.18 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  34.78 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0655  YCII-related  35.38 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.622493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  30.14 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  33.33 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  33.33 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  33.33 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  33.33 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2366  YCII-related protein  31.34 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  33.33 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  33.7 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1112  hypothetical protein  31.03 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  33.85 
 
 		 97 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0675  YCII-related  33.85 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0662  YCII-related  33.85 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  30.43 
 
 		 97 aa  40.8  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  31.51 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  30.43 
 
 		 97 aa  40.8  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  30.43 
 
 		 97 aa  40.8  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  30.43 
 
 		 97 aa  40.8  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  30.43 
 
 		 97 aa  40.8  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  30.43 
 
 		 97 aa  40.8  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  30.43 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  30.43 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1599  hypothetical protein  23.29 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.32365  normal  0.712255 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2002  YCII-related  28.33 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000615778  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  42.62 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3667  YCII-like protein  24.69 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  31.88 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>