39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1796 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  201  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  69.77 
 
 		 88 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1263  YCII-related  67.05 
 
 		 88 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1599  hypothetical protein  62.07 
 
 		 88 aa  130  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.32365  normal  0.712255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0886  hypothetical protein  63.64 
 
 		 88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3667  YCII-like protein  62.79 
 
 		 88 aa  118  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4419  hypothetical protein  59.09 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  40.79 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17051  hypothetical protein  27.96 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1079  hypothetical protein  27.18 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19541  hypothetical protein  28.16 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2015  hypothetical protein  34.02 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17171  hypothetical protein  24.73 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1804  YCII-related  32.5 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0682479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  30.67 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1605  hypothetical protein  25.81 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  35.82 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  34.72 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  31.82 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23561  hypothetical protein  31.96 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.202384 
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  40.58 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16931  hypothetical protein  26.76 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.476637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  33.82 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2257  YCII-related protein  33.85 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1746  YCII-related  28.36 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.333577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00344  hypothetical protein  37.31 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00356549  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  34.72 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  34.72 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1134  hypothetical protein  35.62 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  34.72 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2722  YCII-related  39.06 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  28.38 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  29.11 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1911  YCII-related  33.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  27.54 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.851112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  35.82 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  35.82 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0106441  normal  0.0118299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>