23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2257 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2257  YCII-related protein  100 
 
 
84 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00344  hypothetical protein  38.75 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00356549  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2722  YCII-related  36.25 
 
 
87 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  34.85 
 
 
96 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  33.85 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0565  YCII-related protein  45.83 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.799624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  30.49 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16931  hypothetical protein  28.57 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.476637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  34.85 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17171  hypothetical protein  27.14 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321834  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17051  hypothetical protein  28.57 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1599  hypothetical protein  30.77 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.32365  normal  0.712255 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  39.58 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  26.09 
 
 
102 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1605  hypothetical protein  30.77 
 
 
97 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2015  hypothetical protein  30.11 
 
 
102 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1943  hypothetical protein  36.36 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0106441  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  33.82 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  33.82 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  32.79 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  32.81 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0886  hypothetical protein  28.57 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1746  YCII-related  29.69 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.333577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>