14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1943 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1943  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  337  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0106441  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1725  hypothetical protein  63.92 
 
 		 174 aa  197  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.084277  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2076  YCII domain-containing protein  61.44 
 
 		 160 aa  192  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000637229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2968  YCII-related protein  47.62 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4444  YCII-related  50.43 
 
 		 286 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0302948  normal  0.210377 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02795  hypothetical protein  30.67 
 
 		 167 aa  87.8  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1127  YCII-related  39.73 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2165  YCII-related  41.82 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.0780473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3578  hypothetical protein  27.47 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  28.57 
 
 		 133 aa  44.3  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  40 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05771  YciI-like protein  31.4 
 
 		 89 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2257  YCII-related protein  36.36 
 
 		 84 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  40.8  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>