17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4444 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4444  YCII-related  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0302948  normal  0.210377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2968  YCII-related protein  54.69 
 
 		 148 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1725  hypothetical protein  51.22 
 
 		 174 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.084277  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1943  hypothetical protein  50.43 
 
 		 166 aa  123  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0106441  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2076  YCII domain-containing protein  49.58 
 
 		 160 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000637229  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01990  hypothetical protein  40.17 
 
 		 124 aa  82  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2288  hypothetical protein  36 
 
 		 159 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0025  hypothetical protein  33.61 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00676979  normal  0.250652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2286  hypothetical protein  32.26 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  38.81 
 
 		 97 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02795  hypothetical protein  32.69 
 
 		 167 aa  48.9  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1970  hypothetical protein  30.08 
 
 		 153 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212557  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  35.38 
 
 		 133 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  37.31 
 
 		 97 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  34.92 
 
 		 100 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3578  hypothetical protein  30.53 
 
 		 112 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2369  hypothetical protein  24.27 
 
 		 146 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.149331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>