13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2076 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2076  YCII domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  334  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000637229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1725  hypothetical protein  58.75 
 
 		 174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.084277  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1943  hypothetical protein  61.44 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0106441  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2968  YCII-related protein  47.58 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4444  YCII-related  49.58 
 
 		 286 aa  121  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0302948  normal  0.210377 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02795  hypothetical protein  32.52 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1127  YCII-related  40.91 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  29.46 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1712  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.52 
 
 		 240 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2165  YCII-related  40 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.0780473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3578  hypothetical protein  29.67 
 
 		 112 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  40 
 
 		 97 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>