9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1134 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1134  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0968  YCII-related  42.86 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0868202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1112  hypothetical protein  30.84 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  41.27 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  35.62 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  41.27 
 
 		 97 aa  43.9  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1725  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.084277  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2076  YCII domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000637229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1746  YCII-related  35.62 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.333577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>