15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1725 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1725  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.084277  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1943  hypothetical protein  63.92 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0106441  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2076  YCII domain-containing protein  58.75 
 
 		 160 aa  195  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000637229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2968  YCII-related protein  48.85 
 
 		 148 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4444  YCII-related  51.22 
 
 		 286 aa  124  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0302948  normal  0.210377 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02795  hypothetical protein  36.73 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2165  YCII-related  43.75 
 
 		 109 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.0780473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1127  YCII-related  42.37 
 
 		 109 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238698  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  35.71 
 
 		 97 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05771  YciI-like protein  35.21 
 
 		 89 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  40.32 
 
 		 97 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3578  hypothetical protein  28.57 
 
 		 112 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  36.49 
 
 		 97 aa  40.8  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3993  hypothetical protein  34.29 
 
 		 105 aa  40.8  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>