14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1112 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1112  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  258  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1134  hypothetical protein  30.84 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0968  YCII-related  33.66 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0868202 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16931  hypothetical protein  31.58 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.476637  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  31.17 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5656  YCII-related  31.91 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  24.73 
 
 
96 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0666  YCII-related domain protein  35.29 
 
 
109 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  35.29 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  30 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  30.59 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  31.03 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0815  YCII-related  35.29 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17171  hypothetical protein  29.73 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>