27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2015 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2015  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  208  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0327  hypothetical protein  73.53 
 
 
102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  44.9 
 
 
102 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23561  hypothetical protein  55.56 
 
 
102 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.202384 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1079  hypothetical protein  44.9 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19541  hypothetical protein  43.88 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1605  hypothetical protein  40.43 
 
 
97 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17051  hypothetical protein  40.43 
 
 
99 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17171  hypothetical protein  39.36 
 
 
97 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321834  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16931  hypothetical protein  36.08 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.476637  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  33.33 
 
 
88 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3667  YCII-like protein  35.48 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1263  YCII-related  32.29 
 
 
88 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1599  hypothetical protein  31.96 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.32365  normal  0.712255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0886  hypothetical protein  31.18 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  34.02 
 
 
97 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  29.49 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  32.86 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  28.74 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  38.57 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  25.71 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  31.17 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  28.57 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4419  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2257  YCII-related protein  30.11 
 
 
84 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  35.29 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  27.06 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>