19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1079 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1079  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  219  8e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19541  hypothetical protein  98.15 
 
 
108 aa  216  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  50.51 
 
 
102 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2015  hypothetical protein  44.9 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23561  hypothetical protein  48.98 
 
 
102 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.202384 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17051  hypothetical protein  43.43 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1605  hypothetical protein  43.3 
 
 
97 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17171  hypothetical protein  45.26 
 
 
97 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321834  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16931  hypothetical protein  44.33 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.476637  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0327  hypothetical protein  43.88 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  27.18 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3667  YCII-like protein  30.11 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0886  hypothetical protein  34.74 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1263  YCII-related  35.62 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1599  hypothetical protein  36.17 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.32365  normal  0.712255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  30.93 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  28.38 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  25 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4419  hypothetical protein  31.18 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>