34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23561 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_23561  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  208  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.202384 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  58.82 
 
 
102 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2015  hypothetical protein  55.56 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1079  hypothetical protein  48.98 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19541  hypothetical protein  48.98 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17171  hypothetical protein  42.55 
 
 
97 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321834  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1605  hypothetical protein  39.36 
 
 
97 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17051  hypothetical protein  39.36 
 
 
99 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0327  hypothetical protein  50.51 
 
 
102 aa  86.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16931  hypothetical protein  35.42 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.476637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0886  hypothetical protein  34.41 
 
 
88 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  34.38 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1263  YCII-related  35.05 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  31.96 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1599  hypothetical protein  29.9 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.32365  normal  0.712255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3667  YCII-like protein  32.26 
 
 
88 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  32.93 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  29.11 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  31.73 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  32.93 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4419  hypothetical protein  30.11 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2257  YCII-related protein  29.55 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  25.64 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  34.15 
 
 
100 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  35 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2132  YciI-like protein  32.14 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1762  YCII-related  29.47 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106659  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1054  YciI-like protein  34.88 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104845  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  32.89 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  26.03 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  26.03 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1112  hypothetical protein  29.49 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  24.66 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0660  hypothetical protein  28.26 
 
 
94 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>