30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1263 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1263  YCII-related  100 
 
 		 88 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  94.32 
 
 		 88 aa  177  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0886  hypothetical protein  76.14 
 
 		 88 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  67.05 
 
 		 97 aa  131  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1599  hypothetical protein  63.64 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.32365  normal  0.712255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3667  YCII-like protein  62.5 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4419  hypothetical protein  61.36 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  36.84 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2015  hypothetical protein  32.29 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  32.99 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1079  hypothetical protein  35.62 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19541  hypothetical protein  31.96 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23561  hypothetical protein  35.05 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.202384 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16931  hypothetical protein  35.21 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.476637  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  35.29 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0327  hypothetical protein  34.38 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  33.33 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17051  hypothetical protein  30.11 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  29.85 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1605  hypothetical protein  31.88 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1746  YCII-related  32.86 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.333577  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17171  hypothetical protein  27.96 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321834  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  27.63 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  36.21 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  34.33 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  34.33 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0139  YCII-like protein  39.06 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  31.76 
 
 		 95 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  32.39 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>